La única manera que una factura te pueda ser útil para deducir es que sea original, por lo que en caso de que un CFDI llegara a ser falso, deberás exigir al proveedor que te proporcione una que no sea apócrifa.
Si tú eres cliente de un proveedor de CFDI, solicita a este que lo más pronto posible te apoye con certificarse ante el SAT para que no te veas afectado.
El emitir una factura apócrifa es ilegal, por lo que, si eres víctima de ello te recomiendo reportarlo a la autoridad. La denuncia puede ser anónima.